Sur un arbre de parenté, on place les espèces fossiles sur les branches, comme les espèces actuelles. Un fossile n'est pas un ancêtre commun, il n'est donc pas sur un nœud !
Les humains et les oiseaux ont des liens de parenté puisqu'ils ont des caractères en commun comme un squelette osseux. Il y a eu dans le passé un ancêtre commun dont certains descendants sont devenus des humains et d'autres des oiseaux. Cependant on ne peut remonter dans le temps et vérifier l'existence de cet ancêtre, il est donc hypothétique car on n'aura jamais de preuve directe de son existence. Il a très peu de chance d'être devenu un fossile. Un fossile n'est donc pas un ancêtre commun à un groupe, puisqu'il y a une preuve de son existence, mais il partage des liens de parenté avec d'autres espèces.
On ne peut savoir à quoi ressemblait exactement cet ancêtre commun, on peut seulement connaître une partie des caractères qu'il possédait.