Enseignement scientifique Terminale - 2024

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Activité 2 - documentaire

La biodiversité sur Terre

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Introduction

La biodiversité mondiale résulte d'une longue histoire évolutive et comprend les trois échelles du vivant : écosystémique, spécifique et génétique. Si 2 130 000 espèces sont connues en 2024, on estime qu'il en existerait des dizaines de millions.

Problématique
Quelles méthodes permettent d'estimer la biodiversité mondiale ?
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Ce que j'ai déjà vu

  • Les échelles de la biodiversité
  • Notion d'espèce
  • Calcul de proportion
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Documents

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Doc. 1
Échantillonner la biodiversité spécifique

Placeholder pour Transect sous-marinTransect sous-marin
Transect sous-marin

Placeholder pour Quadrat délimitant une zone étudiéeQuadrat délimitant une zone étudiée
Quadrat délimitant une zone étudiée

La richesse spécifique correspond au nombre d'espèces dans un milieu. Pour étudier cette biodiversité spécifique, les chercheurs disposent de plusieurs techniques comme les quadrats ou les transects. Un quadrat est une surface carrée ou rectangulaire au sol, dans laquelle un relevé exhaustif des espèces présentes est réalisé. Un transect est un trajet linéaire le long duquel sont relevés tous les êtres vivants observés.

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Travaux pratiques

Réaliser un échantillonnage de la biodiversité par quadrat ou par transect


L'objectif est de réaliser un échantillonnage lors d'une sortie scolaire.

Protocole :
  • Placer le quadrat au sol.
  • Relever toutes les espèces présentes dans chacun des carrés du quadrat.

Matériel nécessaire :
  • Quadrat (il peut être réalisé facilement à l'aide d'un cadre en bois sur lequel des fils sont tendus),
  • Clé d'identification des végétaux du milieu étudié. La plus précise possible et idéalement avec des photographies,
  • Appareil photo éventuellement.

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Doc. 2
Des résultats d'études de biodiversité sur le terrain dans les Alpes

Placeholder pour Comparaison des espèces trouvées par l'étude de quadrats au col du Galibier (Alpes)Comparaison des espèces trouvées par l'étude de quadrats au col du Galibier (Alpes)
Comparaison des espèces trouvées par l'étude de quadrats au col du Galibier (Alpes)


De 1997 à 1999, les chercheurs de la station alpine du Lautaret et du Laboratoire d'écologie alpine ont échantillonné 75 quadrats de 5 × 5 m au lieu-dit Avaro (commune de Valloire), au col du Galibier, une prairie alpine de 20 000 m2. Les relevés ci-contre présentent les espèces identifiées aux quadrats 37 et 70.
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Doc. 3
Des méthodes modernes d'étude de la biodiversité : la métagénomique ou génomique environnementale

Placeholder pour Des méthodes modernes d'étude de la biodiversitéDes méthodes modernes d'étude de la biodiversité

Principe de l'analyse génétique d'un échantillon


La métagénomique consiste à étudier directement l'ADN présent dans un échantillon issu de l'environnement (sol, air, intestin, océan, etc.). En comparant toutes les séquences d'ADN retrouvées dans l'échantillon aux banques de données rassemblant toutes les séquences connues, les chercheurs peuvent identifier les espèces qui se trouvent dans l'échantillon. Ces méthodes permettent d'identifier des espèces très difficiles à étudier en laboratoire. Elles sont cependant coûteuses et ne peuvent pas complètement remplacer les reconnaissances sur le terrain.
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Doc. 4
L'expédition Tara Oceans : une étude métagénomique de l'océan

De 2009 à 2013, les équipes de recherche de Tara ont réalisé une étude de la diversité des micro-organismes marins.

Placeholder pour Carte sur l'abondance relative des différents taxons de plancton
dans trois des lieux étudiés.Carte sur l'abondance relative des différents taxons de plancton
dans trois des lieux étudiés.
a. Diversité spécifique en fonction de la localisation géographique et b. goélette Tara

La carte ci-dessus présente l'abondance relative des différents taxons de plancton dans trois des lieux étudiés. Les échantillons sont pris en surface.
Placeholder pour Richesse spécifique et abondance en fonction de la profondeurRichesse spécifique et abondance en fonction de la profondeur
Richesse spécifique et abondance en fonction de la profondeur


Placeholder pour Répartition taxonomique des 40 millions
de gènes séquencés par Tara OceansRépartition taxonomique des 40 millions
de gènes séquencés par Tara Oceans

Répartition taxonomique des 40 millions de gènes séquencés par Tara Oceans

Les graphiques ci-dessus présentent la richesse spécifique et l'abondance des procaryotes (bactéries et archées) selon la profondeur (moyenne de 20 stations).
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Doc. 5
Aperçu de la biodiversité spécifique mondiale avec quelques groupes (ou taxons)

Le nombre total d'espèces peut être extrapolé à partir du nombre d'espèces connues dans chaque taxon. Les estimations dépendent des méthodes de calcul choisies. Pour des espèces plus difficiles à étudier (petite taille, évolution rapide, etc.) comme les bactéries, l'estimation est moins fiable. Certaines recherches menées vont toutefois dans le sens de l'existence de plusieurs centaines de millions d'espèces de bactéries.

TaxonExempleNombre d'espèces décritesNombre d'espèces estimé
Placeholder pour Rhinoc�éros blancRhinocéros blanc
Métazoaires (animaux)Rhinocéros blanc1 124 5169 920 000
Placeholder pour RadiolaireRadiolaire
Chromistes (certains protozoaires et champignons)Radiolaire17 89234 900
Placeholder pour Amanite
tue-mouchesAmanite
tue-mouches
Eumycètes (champignons)Amanite tue-mouches44 368616 320
Placeholder pour Cèdre du LibanCèdre du Liban
Angiospermes (plantes à fleurs)Cèdre du Liban224 244314 600
Placeholder pour AmibeAmibe
Protozoaires (eucaryotes unicellulaires)Amibe16 23672 800
Placeholder pour Methanobrevibacter
smithiiMethanobrevibacter
smithii
ArchéesMethanobrevibacter smithii503Plusieurs milliers voire plusieurs millions
Placeholder pour Staphylocoque doréStaphylocoque doré
BactériesStaphylocoque doré11 010De 5 à 10 millions voire davantage

Source : Mora, C., et al. Plos Biology, 2011
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Questions

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1. Doc. 1 et Doc. 2 Comparer la diversité spécifique des deux quadrats du Galibier et proposer une explication aux différences observées.
2. Doc. 3 Montrer que la métagénomique facilite considérablement l'étude de la biodiversité.
3. Doc. 4 Comparer et commenter la richesse taxonomique des différents lieux échantillonnés lors de l'expédition Tara Oceans.
4. Doc. 4 Décrire l'impact de la profondeur sur la structuration de l'écosystème marin.
5. Doc. 5 Tracer deux diagrammes circulaires donnant l'abondance relative de chaque taxon du tableau. Commenter le résultat.
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6. Doc. 1, Doc. 2, Doc. 3, Doc. 4 et Doc. 5 Discuter de la complémentarité des différentes méthodes d'étude de la biodiversité.
Afficher la correction
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Supplément numérique

Retrouvez des sur la biodiversité en France.
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Vocabulaire

Espèce (définition phylogénétique) : ensemble d'êtres vivants partageant une combinaison unique de caractères (morphologiques et/ou moléculaires).

Taxon : groupe d'êtres vivants (espèce, famille, ordre, etc.).

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