Le Gai Savoir est publié en 1882. Nietzsche l'écrit en un mois, en janvier 1882, à Gênes, à partir de notes rédigées durant l'été 1881. Il considère cet ouvrage comme une suite d'Aurore. La clarté serait élevée, selon lui, à un degré supérieur dans Le Gai Savoir.

• Dans les livres I et II, il est question de la morale, des passions, des femmes, de l'artiste et des arts.
• Le livre III — objet de la présente étude — est consacré pour partie à la science et pour partie à la religion.
• Le livre IV traite de la façon de mener sa vie, et de la volonté de puissance : il peut être considéré comme un prélude à Ainsi Parlait Zarathoustra, notamment par le ton lyrique adopté.
• Enfin, le livre V aborde la question de la croyance, des savants, et de l'importance des sens.

Nietzsche clarifie le concept de « santé ». Celle-ci n'est pas le contraire de la maladie. La santé n'est pas un état figé ; il s'agit, selon Nietzsche, d'un processus de dépassement, qui n'exclut pas la maladie. La santé est une façon de répondre à la maladie, et non l'état d'un corps qui serait à l'abri de toute maladie.

Chercher à éradiquer la maladie, selon Nietzsche, est un non-sens ; il énonce d'ailleurs dans le livre V « une santé que l'on ne se contente pas d'avoir, mais que l'on conquiert encore et doit conquérir continuellement ». La santé n'est donc pas conçue comme une norme du corps que l'on dirait « sain ». Il n'y a pas un seul modèle de santé, mais plusieurs « santés », propres à différents corps. Nietzsche considère qu'il n'y a pas de santé « en soi » : « il importe de connaître ton but, ton horizon, tes forces, tes impulsions, tes erreurs et surtout l'idéal et les fantômes de ton âme pour déterminer ce que signifie la santé, même pour ton corps. Il existe donc d'innombrables santés du corps ». Ibid.

Ici, nous pouvons envisager la lecture d'un extrait de l'ouvrage Le Normal et le pathologique, de George Canguilhem, pour travailler la notion de maladie, et l'impossibilité de s'appuyer sur le seul écart à une norme supposée ou statistique pour déclarer un patient malade.

Les deux thèmes principaux du livre III sont la science et la religion. Le rapprochement entre ces deux domaines n'est pas fortuit : au XIX^e siècle, la science tend à remplacer la religion. Ce que montre Nietzsche, c'est que la recherche de la vérité produit une morale, tout comme la religion. La science prétend viser l'objectivité, mais ses outils la renvoient toujours à l'homme.

Par exemple, en appliquant les mathématiques au monde qui nous entoure, nous ne décrivons pas ce monde, nous en construisons une image pour nous le rendre familier, et cette image est humaine, car les mathématiques sont un langage que nous produisons.

Par ailleurs, la science est incapable d'expliquer le réel, et ce pour deux raisons principales : en premier lieu, elle suppose une causalité universelle, mais cette causalité est une hypothèse qui est seulement devenue vérité par habitude. À force de constater que l'action suit la volonté, nous avons supposé que le monde entier était régi par la relation de cause à effet. D'autre part, si la science ne peut pas expliquer le monde, c'est en tant que la cause et l'effet ne peuvent être séparés que si nous introduisons artificiellement de la discontinuité dans l'enchaînement des phénomènes.

Le Gai Savoir prépare le terrain conceptuel pour Ainsi parlait Zarathoustra, où Nietzsche explore la possibilité du dépassement de la morale.

Les deux ouvrages qui s'inscrivent dans la lignée du Gai Savoir sont Ainsi parlait Zarathoustra — rédigé en 1883-1885 — et Par-delà le bien et le mal.

Il écrit dans Ecce homo — rédigé en 1888 — qu'à la fin du quatrième livre du Gai Savoir, nous voyons « apparaître, dans un rayonnement, la beauté diamantine des premières paroles de Zarathoustra ».

Dans Par-delà le bien et le mal, Nietzsche poursuit son étude des valeurs, et notamment nos préjugés quant à leur dualité, par exemple, le couple vérité / erreur. Si le livre III du Gai Savoir est principalement consacré à la science, le premier chapitre de Par-delà le bien et le mal (« Des préjugés des philosophes ») porte sur le concept de vérité.