Alain est durablement influencé par son maître, Jules Lagneau, qui était très marqué par le spinozisme. Alain sera toujours rationaliste comme l'était son maître. Les œuvres d'Alain sont largement des textes rédigés à l'intention de ses élèves ou de la presse, de courts articles témoignant de sa réflexion philosophique, souvent à partir de questions d'actualité.
- Sa pensée est un exercice de réflexion rationnelle, libérée des carcans idéologiques ou religieux, même s'il n'est pas insensible à la dimension universelle du catholicisme. Sa démarche est centrée sur :
- L'âme, principe spirituel gouvernant la personne humaine
- La conscience réflexive, capable de retour critique sur soi
- La morale servant la dignité de la personne humaine
- La volonté comme engagement personnel et sans faille dans l'action
- Dans le Système des Beaux-Arts, Alain tente de comprendre comment l'art concilie l'imagination créatrice et les règles techniques qu'il faut observer pour produire l'œuvre. Il pose aussi une typologie des arts, distingués en deux types : « arts en mouvement » et « arts en repos ». Les œuvres d'art nous montrent comment l'imagination, source d'erreurs, s'applique ici sous une forme maîtrisée.
- Dans les Propos sur l'éducation, le philosophe Alain fait un retour sur l'objectif pédagogique du professeur Émile Chartier. Celui-ci consiste à penser une pédagogie d'où émerge un esprit libre, autonome, critique. Il ne s'agit pas d'emmagasiner des savoirs, mais de parvenir à les interroger. Cette démarche suppose de la part des élèves un travail d'abord pénible dont ils ne comprennent l'intérêt que plus tard ; l'éducateur n'a pas pour mission de distraire, mais d'apprendre à conquérir un empire sur soi.